Массово поставляемые в хозяйства КАССР лошади конезавода №168 оказывали прямое влияние на кабардинскую породу. Они поставлялись в послевоенное время как в колхозы и совхозы, так и в конные заводы. Например, восстанавливаемый в 1958 году Малкинский конный завод №34 укомплектовали карачаевскими и англо-карачаевскими лошадьми завода №168, которые составили до 73% его поголовья. Как известно, ранее, в 1954—1956 годах Малкинский №34 и Кабардинский №110 конезаводы преобразовали в мясомолсовхозы с распродажей почти всего племенного поголовья.
Во II (1949) и III (1953) томах племенных книг о карачаевской лошади не было сказано ничего. Начиная со II тома, племенная книга горских лошадей стала называться племенной книгой кабардинских лошадей, из нее исчезают термины «карачаевская лошадь», «балкарская лошадь». В это время существовал запрет на упоминание связанных с карачаевцами или балкарцами исторических или традиционных терминов. Ситуация изменилась в 1960-х, когда после доклада известного ипполога А. С. Красникова ученый совет ВНИИ коневодства счел целесообразным восстановить в зоотехнической литературе и практике названия «карачаевская» и «англо-карачаевская» для групп лошадей, разводимых в Карачаево-Черкесии. В виде подтипа кабардинской породы, карачаевскую лошадь включили в IV (1964) том племенной книги.
Так в коневодстве Карачая и сложилась такая ситуация, достаточно нелепая, когда, выращивая на своей земле свою породу лошадей, надо было называть ее кабардинской. Особо этому удивляться не стоило, поскольку полная реабилитация самого карачаевского народа наступила лишь в 1991 году. Вопросом восстановления карачаевской породы занимались Б. Д. Узденов, Х. М. Мамаев, К.-Г. М. Урусов, В. А. Парфенов, В. Х. Хотов, и многие другие неравнодушные к этому люди, и в конечном итоге справедливость восторжествовала.
Карачаевскую породу лошадей восстановили в 1989 году, и официальный статус окончательно закрепился в 1993 году, когда была издана «Государственная племенная книга лошадей кабардинской и карачаевской породы», V том. К карачаевской породе в ней отнесены лошади племенных хозяйств, ее разводивших: Карачаевского конного завода, колхозов, совхозов, госконюшен. К кабардинской породе – лошади Малкинского конного завода, по большей части карачаевские и англо-карачаевские, лошади кабардинских госконюшен, в том числе карачаевские, а также собственно кабардинские лошади, в основном сосредоточенные в колхозах и совхозах. В пору «лихих 90-х» кабардинская порода в подавляющем большинстве этих хозяйств была потеряна.