Долгое время в монастыре было только 12 иноков. Сначала прибывающие послушники носили мирскую одежду, работали, а Сергий наблюдал за ними, испытывая их трудностями, и лишь после этого решал принять их в монашескую братию.
Сергий зимой и летом ходил в простой рясе, сам много трудился и требовал того же от других (однажды он даже хотел оставить обитель из-за того, что наступили раздоры и непослушание среди братии).
В создании монастыря Сергий произвел настоящую революцию. Не разделяя монастырь для выходцев из бедных и богатых семей, он создал общежительный монастырь по примеру коммун древнего Египта, в которых монахи не владели никакой собственностью, труд их был безвозмездным и плоды труда принадлежали монастырю. Также Сергий запрещал монахам выходить за стены монастыря для сбора подаяний.
Преподобный не хотел быть игуменом монастыря, говоря, что это желание – «начало и корень властолюбия».
Одним из первых его келарей был Никон, он ведал казной и занимался хозяйственной деятельностью, после Никон стал игуменом монастыря.
Необходимым условием «высокого жития» было единомыслие, единство мыслей и действий всех иноков, подающих пример всей Руси. Не случайно обитель Сергий посвятил Троице – как символ единства мыслей и действий. Троица – это образ единства и любви, а впоследствии – символ единства Руси.
Через 100 лет Рублев напишет Троицу как мечту о единении всех русских.
В задачу Сергия входило духовное пробуждение народа как основы собираемой русской государственности. Без всяких нравоучений и призывов он перестраивал нравственное сознание людей 14 века.
Преподобный Сергий жил в жесточайшую эпоху. В каждой молитве он просил Бога о даровании порабощенному народу силы и обретения воли и разума. По мнению Сергия, страдание верующих во имя Христа должно осветлять душу, а не истязать тело.
Ученики Сергия шли в другие места основывать новые обители духа (а племянник Сергия, Федор, основал Симонов монастырь на Москва-реке). Часто преподобный и сам покидал монастырь, чтобы основать новую обитель. По просьбе митрополита Алексея Сергий благословил основание Спас-Андроникова монастыря на Яузе. Митрополит Московский Алексей просил Сергия стать его приемником, но Сергий отказался.
Предвидя свою кончину, Сергий за полгода начал безмолвствовать.