Прибыв в Индию в 1997 году, Лама три года учился в школе философии Далай-ламы. Под руководством мастера по имени Нангва Пал он изучил пять важных трактатов буддийской философии: «Совершенство мудрости», «Срединный путь», «Действенное познание», «Монашеская дисциплина» и «Сокровищница знания». Затем Лама преподавал философию большому числу монахов.
Позднее Лама направился в монастырь Джонанг Тактен Пунцок Чолинг в Шимле (Индия) – главный монастырь традиции Джонанг за пределами Тибета. Этот монастырь в свое время Его Святейшество Далай-лама XIV даровал Халхе Джецуну Дамбе Богдо-гегену Ринпоче IX. В течение пяти лет Лама Йонтен Гиалтсо был заместителем настоятеля монастыря. Являясь одним из главных учителей, он время от времени также давал в Дхарамсале учения иностранцам. Под его руководством в монастыре была построена библиотека. Лама стал основным спонсором строительства ретритного центра для интенсивной практики шести йог Калачакры. С тех пор монахи непрерывно выполняют стадию завершения тантры Калачакры, сменяя друг друга группами по десять человек.
В 2003 году глава школы Джонанг, Халха Джецун Дамба Богдо-геген Ринпоче IX, уполномочил Ламу Йонтена Гиалтсо передавать обширное учение традиции Джонанг в России и других странах. С тех пор Лама Йонтен Гиалтсо большую часть времени находится в России, где делится знаниями и опытом со своими учениками.
Под руководством Ламы Йонтена Гиалтсо в 2009 году в Москве открылся Дхарма-центр традиции Джонанг, который в 2016 году был зарегистрирован как Местная религиозная организация «Буддистский центр „Калачакра“», где ученики осваивают предварительные практики (нендро) традиции Калачакры, практики пхова (перенос сознания в чистую землю), шаматха (однонаправленная концентрация) и випашьяна (глубинное видение), получают устные наставления, передачу мантр и комментарии по выполнению практик.
С благословения Ламы функционируют дхарма-центры и группы практикующих в таких городах России, как Москва, Санкт-Петербург, Казань (Республика Татарстан), Симферополь (Республика Крым) и Севастополь, а также в Кишиневе (Республика Молдова) и Минске (Республика Беларусь).
В апреле 2020 года с благословения Учителя началось строительство ретритного центра Нгедон Чокор Линг в Крыму.