Родился Пифагор около 570 г. до н. э. на острове Самос в Эгейском море у берегов Малой Азии. Отцом его был золотых дел мастер Мнесарх, который славился среди мастеров своим искусством вырезать геммы, но стяжал скорее славу, чем богатство. Имя матери Пифагора не сохранилось, но Мнесарх якобы звал жену Пифаидой, а сына Пифагором в честь дельфийской прорицательницы Пифии, предсказавшей рождение необыкновенного сына, что прославится в веках своей мудростью, делами и красотой.
Пророчество чудесным образом сбылось: ребенок родился на диво красивым, а вскоре проявился и острый ум мальчика. Счастливый отец воздвигает алтарь Аполлону и окружает сына заботами. Старый рапсод (странствующий певец Древней Греции) Гермодамант и философ Ферекид (осмелившийся ранее других писать простым языком, вольным слогом, прозаическим стилем) занялись его образованием. У своего первого учителя Пифагор получает знания основ музыки и живописи, а второй обратил его ум к логосу. Единство музыки, поэзии и отточенной мысли, с малых лет усвоенное Пифагором, оказало на его мировоззрение огромное воздействие. Для упражнения памяти Гермадамант заставлял учить песни из «Одиссеи» и «Илиады». Он прививал юному Пифагору любовь к природе и ее тайнам. «Есть еще и другая школа, – поучал он, – твои чувствования происходят от Природы, да будет она первым и главным предметом твоего учения».
Пифагор выходит из подземного мира. Художник С. Роза
Но вот Самос становится для юноши тесным, к тому же умирает его отец, и Пифагор тайно (властитель Самоса Поликрат такое преследовал) бежит с острова, решив продолжить образование в Египте, этой своеобразной для древних эллинов научной Мекке. Путь был далек и опасен, а все дороги вели через Милет, и здесь юный Пифагор внимательно слушает лекции Фалеса, основателя первой философской школы, тогда уже восьмидесятилетнего старца, и его более молодого коллегу и ученика Анаксимандра, выдающегося географа и астронома. Много важных знаний приобрел Пифагор за время пребывания в милетской школе, но Фалес советует ему за знаниями продолжить путь в Египет.
Перед Египтом Пифагор на некоторое время останавливается в Финикии, где, по преданию, учится у знаменитых сидонских жрецов. Пока он живет в Финикии, его друзья добиваются того, что Поликрат не только прощает беглеца, но даже посылает ему рекомендательное письмо для Амазиса – фараона Египта. А там благодаря высокому покровителю Пифагор знакомится с мемфисскими жрецами. Ему удается проникнуть в «святая святых» – египетские храмы, куда чужестранцы не допускались. Чтобы приобщиться к тайнам египетских храмов, Пифагор, следуя традиции, принимает посвящение в сан жреца.