На основании этой директивы по решению командующего 9-й армией в 00 часов 22 июня 1941 года соединения и части армии, прикрывавшие государственную границу, телеграфным распоряжением были приведены по тревоге в боевую готовность и получили приказ занять районы по плану прикрытия.
По воспоминаниям адмирала Н.Г. Кузнецова силы военно-морского флота в то время также были приведены в боевую готовность, и, как показали события первых часов Великой Отечественной войны, не зря. Уже в ходе своего первого налета немецкая авиация бомбила Севастополь.
Однако наступление противника в полосе 9-й армии Одесского военного округа в первые дни войны развивалось медленно, что позволяло советским войскам довольно успешно отражать атаки неприятельских войск. Ещё 21 июня 1941 г. решением Политбюро ЦК ВКП(б) был образован Южный фронт, формирование управления которого поручалось штабу Московского военного округа. Командование этим фронтом возлагалось на генерала армии И.В. Тюленева. В состав фронта с 25 июня вошли 9-я, 18-я армии, 9-й особый, 55-й, 7-й стрелковые корпуса, а также части фронтового подчинения, которые дислоцировались не только в районе Одессы, но и в Крыму.
Таким образом, Южный фронт должен был оборонять полосу шириной около 700 километров от Карпат до устья Дуная, а также участок побережья Черного моря и полуостров Крым. При этом проблеме установления контроля над советской частью побережья и акваторией Черного моря придавалось особое значение.
К сожалению, военные действия в Крыму в 1941 году для Красной армии сложилась неудачно. В начале июня 1942 года, после многодневной героической обороны, был оставлен Севастополь. К тому времени фашистские войска, овладев Ростовом-на-Дону, прорвались на Кубань и вышли к предгорьям Кавказа. Но победа советских войск под Сталинградом навсегда разрушила гитлеровские планы прорыва на Баку.
Со второй половины 1943 года, с началом проведения советским командованием крупномасштабных наступательных операций, борьба за контроль над Черным морем снова становится крайне актуальной. Она рассматривается не только с точки зрения надежного обеспечения левого фланга советско-германского фронта, но и как существенный рычаг давления на Турцию и некоторых союзников Германии. Поэтому операциям по освобождению Крыма советское командование придавало особое значение.