Элейн Пагелс, профессор религиоведения в Принстонском университете, посвятила свои исследования гностическим текстам, включая «Евангелие от Фомы» и «Евангелие от Марии». В своих книгах «Гностические евангелия» и «Евангелие от Фомы» она утверждает, что гностицизм представлял собой не еретическое отклонение, а полноценное направление в раннем христианстве. Пагелс подчеркивает, что гностические тексты акцентируют внимание на внутреннем знании (гнозисе) и личном опыте Бога, в отличие от ортодоксального христианства, которое сосредоточено на церковных таинствах и догматах. Она также отмечает, что в гностических текстах женщины, такие как Мария Магдалина, изображаются в роли духовных лидеров, что противоречит патриархальной традиции канонических текстов.
Карен Кинг, профессор Гарвардского университета, в своих исследованиях «Евангелия от Марии Магдалины» и «Иисус и Богиня София» анализирует роль женщин в раннем христианстве. Кинг считает, что Мария Магдалина могла быть не просто ученицей, но и одним из ключевых апостолов, обладавшим глубоким мистическим знанием. В «Евангелии от Марии» Иисус передаёт ей откровение, которое не дано другим ученикам, однако её авторитет оспаривается Петром, что могло отражать реальные конфликты в общинах за лидерство и признание. Кинг также предполагает, что исключение таких текстов из канона могло быть связано с желанием церковных лидеров утвердить патриархальную иерархию, исключив женщин из духовного руководства.
Джеймс Робинсон, один из главных редакторов библиотеки Наг-Хаммади, также подчеркивает, что апокрифические тексты могут содержать древние традиции, возможно, даже более ранние, чем канонические евангелия. Он считает, что «Евангелие от Фомы», представляющее собой сборник изречений Иисуса, могло опираться на устные традиции, которые существовали ещё до написания синоптических евангелий. Робинсон утверждает, что это евангелие предлагает иной взгляд на Иисуса как мистического учителя, передающего знания о божественной искре внутри каждого человека. Такое понимание могло бы изменить акценты в христианской теологии, если бы этот текст был принят в канон.
С другой стороны, Н. Т. Райт, известный теолог и епископ Англиканской церкви, занимает более традиционную позицию. В своих трудах он утверждает, что канонические евангелия являются наиболее надёжными источниками о жизни и учениях Иисуса. Райт полагает, что апокрифические тексты, особенно гностические, создавались значительно позже и отражают влияние эллинистической философии, которая искажала изначальное иудейское учение Иисуса. Он считает, что гностические тексты переосмысливали фигуру Иисуса в духе мистицизма, отдаляя его от исторического контекста и подменяя идею искупления через крест символикой тайного знания.