Оставшиеся структурные подразделения составили основу Межреспубликанской службы безопасности СССР – основного правопреемника КГБ. Руководителем МСБ СССР был назначен Бакатин, который вначале по предложению министра обороны Шапошникова хотел передать Третье главное управление КГБ в Минобороны, но встретил сопротивление и вынужден был согласиться с доводами, что это могло превратить военную контрразведку в карманную структуру военного ведомства.
Однако по требованию министра внутренних дел Баранникова военная контрразведка временно прекратила контроль за внутренними войсками, СВД и милицией, но осталась в составе КГБ-МБ-ФСБ.
Ретроспектива
Дед Бакатина, учитель, был расстрелян в 1937 году. Вадим Бакатин, назначенный Горбачевым министром МВД, начал мстить органам за гибель деда. Первым делом он провел операцию «Чистое поле», уволив без выходного пособия и пенсии 90 % платной агентуры, участвовавшей в разработке криминальных авторитетов и воров в законе.
Затем, став председателем КГБ, учинил настоящий разгром органов госбезопасности и не скрывал этого – в книге «Избавление от КГБ» он написал: «Я вынужден был не просто начать забой скота – его истребление…» В 1992 по 1997 год руководил департаментом политических и межнациональных исследований в Международном фонде экономических и социальных реформ (фонд «Реформа»).
До 1995 года с семьёй проживал в штате Алабама в коттедже Олега Калугина. В 1996 году руководство ЦРУ отказалось от его услуг как консультанта и предложило покинуть территорию США.
В Москве по ходатайству руководителя МИД Козырева Бакатин был принят Ельциным и выпросил пятикомнатную квартиру на Фрунзенской набережной, где живет до настоящего времени. В Москве Бакатин оказывал протекцию главе банка «Столичный» Смоленскому, затем стал членом консультационного совета британско-швейцарской инвестиционной компании «Capital Vostok».
Его сын Дмитрий в 30 лет стал управляющим директором компании «Ренессанс Капитал» и заместителем председателя правления АКБ «Международный финансовый клуб». В 2001–2003 годах первым заместителем гендиректора «Газпром-Медиа». Член исполкома Российско-американского совета делового сотрудничества.
Спецслужбы Запада наблюдали за вакханалией на руинах уничтоженного КГБ с явным злорадством. Они отлично понимали, каковы будут последствия. Тема разъединения разведки и контрразведки неоднократно обсуждалась в ходе неофициальных контактов сотрудников КГБ и ЦРУ. Американцы, с одной стороны, гордились самостоятельностью ЦРУ, с другой – завидовали КГБ, где разведка и контрразведка находились в одном ведомстве, под единым руководством, на собственном опыте зная, что плохое взаимодействие ЦРУ с ФБР создает разобщенность и преобладание в ЦРУ и ФБР ведомственных интересов.