При князе Всеволоде Большое Гнездо, родном брате Андрея Боголюбского, великое Владимирское княжение достигло своего наивысшего расцвета. В 1207 г. князь Всеволод из своих обширных владений вычленил самостоятельное Ростовское княжество которое отдал своему сыну Константину, и тот привел его в цветущее состояние. С именем Константина Всеволодовича связаны и новые административные преобразования в церковной иерархии. В 1215 г. Ростовскую епархию поделили надвое, так была образована самостоятельная Владимиро-Суздальская епархия.
В 1216 г., уходя на великий Владимирский стол, князь Константин Всеволодович разделил свое обширное Ростовское княжество между тремя сыновьями: старшему Василько дал Ростов, среднему Всеволоду – Ярославль, младшему Владимиру – Углич. Так появились новые самостоятельные уделы, просуществовавшие до времен Ивана III.
В начале XIII в. с восточных рубежей надвинулась доселе угроза, – вражеские полчища татар. В 1224 г. произошла кровопролитная битва на р. Калке. В конце декабря 1238 г. была покорена Рязань, в начале января пала Коломна, 20 января взята Москва, в начале февраля были выжжены Суздаль и Владимир, за ними – Переславль-Залесский и Тверь, в мае началась семинедельная осада Козельска, который затем был стерт с лица земли. На реке Сити было уничтожено соединенное русское войско, и погиб великий владимирский князь Юрий Всеволодович. После Батыева нашествия от многих цветущих городов остались лишь пепелища. Спасаясь от неприятеля, люди бросали свои дома и бежали в леса. Так основывались новые поселения и, в частности, возник город Липецк и знаменитое село Палех. В 1239 г., в утешение скорбящим, на опустошенной земле просиял Федоровский образ Богоматери.
Во второй половине XIII в. к бедам от татарских нашествий прибавились еще ожесточеннейшие княжеские междоусобицы. В 1299 г. митрополит Максим покинул Киев, и перенес свою кафедру во Владимир.
Во второй четверти XIV в. на политическую арену выходит небольшое Московское княжество – удел младшего сына Александра Невского – св. Даниила. Его сын Юрий в 1320 г. получил в Орде ярлык на великое княжение. Его брат Иван I Калита в 1325 г. подтвердил ярлык, потом он удерживался многими поколениями потомков. В том же году св. митрополит Петр, предвидя грядущее значение Москвы, переносит сюда свою кафедру. И хотя Москва стала православным центром государства, ввиду исключительного исторического значения Владимира, древний обряд вокняжения по-прежнему совершался в его Успенском соборе.