Благодаря византийским войскам Неаполь смог противостоять захвату вандалами и лангобардами. Впоследствии византийцы позволили Неаполю образовать автономное герцогство, которое с 763 года стало лишь формально зависимым от Византии.
Герцогство Неаполь должно было постоянно противостоять попыткам завоевания лангобардов и вторжениям сарацинских пиратов, поэтому он был вынужден поставить себя под защиту норманнов, которые тем временем освободили Сицилию от арабов. В 1139 году неаполитанцы окончательно передали город Роджеру Норманну, королю Палермо.
Затем, с 1194 года, город Неаполь следовал за судьбой всей южной Италии, завоеванной швабами.
При Фридрихе (Федерико II) в 1224 году был основан Неаполитанский университет Federico II – один из первых европейских высших учебных заведений.
Швабское правление закончилось в 1266 году, когда южная Италия попала под власть французских анжуйцев. Они перенесли столицу Сицилийского королевства из Палермо в Неаполь, который с тех пор стал одним из важнейших европейских городов.
В XV веке арагонские испанцы завоевали Неаполитанское королевство, а с 1501 по 1713 годы оно стало испанским наместничеством под прямым контролем испанской короны, и его судьба была отделена от Сицилии.
После войны за наследство в Испании Неаполитанское королевство перешло к австрийцам, которые управляли им до 1734 года, когда после войны за наследство в Польше оно перешло к Бурбонам и, наконец, стало независимым. Наступил период процветания и благополучия, которые вернули Неаполю сильные позиции.
В 1816 году Фердинанд Бурбонский объединил две короны – Неаполя и Сицилии, основав Королевство двух Сицилий.
В 1860 году королевство было завоевано войсками пьемонтского короля Витторио Эмануэле II и Гарибальди и вошло в состав новорожденного королевства Италии под руководством Савойи. Молодой Франциск II Бурбонский, последний король Обеих Сицилий, бежал в Гаэту, где позже был захвачен и взят в плен.
Сейчас Неаполь является одним из крупнейших итальянских городов и занимает четвертое место по численности населения. Он сохранил свое историческое и культурное наследие, несмотря на тяжелые моменты в виде безработицы, мусора на улицах и неаполитанской мафии.