Воронцов Михаил Александрович, контр-адмирал – 11.09.1941—10.04.1945 (по не уточненным сведениям – потомок князя и графа Воронцова);
Филипповский Александр Александрович, капитан 1-го ранга—10.04. – 09.05.1945 и 09.08.—03.09.1945;
Румянцев Александр Михайлович, капитан 1-го ранга – 09.05–09.08. 1945 (по не уточненным сведениям – потомок графа и генерал-фельдмаршала Русской армии П. Румянцова).
Начальник управления военных сообщений:
Кечетжи Николай Константинович, генерал-майор береговой службы – 22.06.1941—03.09.1945.
Начальники отдела внешних коммуникаций:
Сендик Иосиф Моисеевич, капитан 1-го ранга – 06.10.1941—13.12.1944;
Сергеев Николай Дмитриевич, капитан 1-го ранга – 13.12.1944—30.08.1945.
Начальники исторического отдела:
Круглов Владимир Ильич, генерал-майор береговой службы – 22.06–16.08.1941 и 05.09.1944—03.09.1945 (креатура Л. П. Берия; исполнитель воли советских историков, создавших капитальные труды по теме: история Русского государства и становления советской державы, – в которых обвинили царизм в жестокой эксплуатации народов, а также заодно и в разрушении Русского флота, в результате чего он проиграл Крымскую войну и войну с Японией… В сложившейся сложной обстановке в июле-сентябре 1941 г. многим деятелям «новой исторической науки» стало не по себе в Ленинграде и Москве, и они, зная, как гестапо поступает с евреями, покинули обе бывшие русские столицы для дальнейшей «творческой деятельности» в столице советского Узбекистана Ташкенте. Подал рапорт с занимаемой должности и начальник исторического отдела Круглов В. И. Именно в то время нарком ВМФ принял решение поставить на должность руководителя исторической службы капитана 2-го ранга Ивана Николаевича Быкова, но не суждено было этому офицеру стать ведущим историком флота… После того, как утрясутся события на фронтах и в столице, «выдающиеся» советские деятели науки, в том числе и Владимир Ильич Круглов, вновь возвратятся на свои «исторические» должности.);
Быков Иван Николаевич, капитан 2-го ранга – 16.08–30.10.1941;
Бологов Николай Александрович, контр-адмирал – 30.10.1941—20.07.1943;
Долинин Михаил Михайлович, контр-адмирал – 20.07.1943—05.09.1944.
Начальники управлений боевой подготовки:
Харламов Н. М., вице-адмирал – 22.06. – 20.07.1941 и 20.11.1944—27.04.1945;