В 1322 году, все еще пребывая под впечатлением от монастыря Джонанг, Долпопа снова отправился туда, чтобы встретиться с Йонтеном Гьямцо и попросить его дать полную передачу Калачакра-тантры, а также многих линий шестичленной йоги (шаданга-йога)[4]. Перед самым прибытием Долпопы в монастырь Джонанг его настоятель Йонтен Гьямцо увидел во сне, как царь Шамбалы Калкин Пундарика поднимает победное знамя буддизма над его монастырем. После столь благоприятного знамения он, разумеется, дал Долпопе все необходимые посвящения, а также глубокие инструкции по практикам и предоставил специальное помещение для медитации.
Несколько позже Долпопа получил дополнительные наставления по таким системам знаний, как Путь-Плод, Гухьясамаджа, Чакрасамвара-тантра, шичжед, чод и многим другим. Затем, после недолгого пребывания в монастыре Сакья, Долпопа снова вернулся в Джонанг и приступил к годичной практике шестичленной йоги в Кхаче Деден. В его биографии переживания этого отшельничества описываются следующим образом: «На основе внутреннего погружения (пратьяхара) и умственного сосредоточения (дхьяна) он узрел бесчисленных Будд и Чистые земли. На основе контроля за дыханием (пранаяма) и удерживания (дхарана) в результате пылающего блаженства внутреннего тепла возникло великое переживание и постижение». Так он стал величайшим мастером шаданга-йоги. Благодаря Долпопе и его ученикам эта линия передачи получила широкое распространение в Тибете, а духовный опыт, получаемый в ходе практики, был должным образом соединен с философским воззрением.
Однажды, вдохновившись величественным видом ступы в Трофу, Долпопа пообещал в будущем построить такую же. После ухода в нирвану Йонтена Гьямцо Долпопа решил возвести ступу в районе Верхнего Зангдена, однако на следующий год место строительства было перенесено в район Нижнего Зангдена. Задуманные размеры этой ступы были настолько громадными для тех времен, что многие и не верили, что она вообще будет когда-либо построена. Для возведения этой ступы стягивались рабочие и мастера со всех концов Тибета. Материалы для строительства и пропитание также свозились из разных мест. Это была поистине стройка века. Такое грандиозное сооружение задумывалось как прообраз великой ступы лунных дворцов (Дханьякатака), в которой Будда впервые явил Калачакра-тантру.