На ошибку князя П.В. Долгорукова указал генеалог Пётр Петров, который помимо русской ветви князей Шуйских, в своём труде, указал разрозненных представителей польских Шуйских, при этом считая польскую ветвь самостоятельным родом.
Подобную путаницу в определении родоначальника рода, исследователи не распутали до сих пор.
Доподлинно известно лишь одно, что они Рюриковичи и потомки великого князя Ярослава Всеволодовича, ставшего старейшим князем в Северо-Восточной Руси после монголо-татарского нашествия. От него происходят князья Ростовские и Белозерские, Московские, Тверские и Суздальские. Его старшим сыном был Святой Александр Невский предок Московской великокняжеской и царской династии.
От Александра Невского выводили свой род и князья Шуйские, потомки Суздальско-Нижегородских удельных князей. По крайней мере, об этом заявлял царь Василий IV Шуйский.
Однако, исследователям эта попытка приписать свой род в Александру Невскому кажется особым политическим ходом царя Василия IV, пытавшимся обосновать свои особые права на русский престол. Угасшая Московская династия, так же выводила свой род от князя Александра Невского, от его младшего сына Святого князя Даниила.
Василий IV называл своим родоначальником среднего сына Александра Невского – удельного князя Андрея Городецкого. Тем самым Шуйские ставили свой род выше Московских царей.
На самом деле, по мнению многих историков, род Суздальских князей произошёл от младшего брата Александра Невского – князя Андрея Ярославича.
Такой точки зрения придерживались историки Н. М. Карамзин, П.Н. Петров, авторитетный исследователей генеалогии русских князей А.В. Экземплярский.
Их оппонентами выступили князь Пётр Долгоруков, С.М. Соловьёв предложившие выводить род Суздальских князей от Андрея Александровича Городецкого.
На сегодняшний день единого мнение историков по вопросу происхождения Суздальских князей нет. Одни называют родоначальником князя Андрея Ярославича, другие – князя Андрея Александровича.
Сторонники версии происхождения Шуйских от Андрея Александровича основывают свои выводы на летописных данных и сведениях синодиков.
Известно, что у князя Александра Ярославича Невского в браке с княжной Александрой Брячиславной Полоцкой было 4-ро сыновей и дочь Евдокия, ставшая супругой князя Константина Ростиславича Смоленского.