Au début des années 2000, des génomes complets de souris, d'humains, de rats et de chimpanzés ont été publiés, qui se sont révélés très proches, mais les données pour l'étude n'étaient pas suffisantes. C'est ainsi que le projet Zoonomia est apparu. Plus de 50 organisations scientifiques de différents pays ont fourni des échantillons d'ADN à ses participants. Les résultats de l'étude ont été publiés sous la forme de 11 articles du numéro thématique de la revue Science. La tâche des participants au projet Zoonomia consistait à identifier les caractéristiques de l'ADN qui déterminent les différences entre les espèces et à déterminer à quel stade de l'histoire de l'évolution ils étaient ancrés au niveau Génétique. Les études ne concernaient que les membres du groupe placentaire qui sont apparus sur la planète au cours des 100 derniers millions d'années et ne concernaient pas les marsupiaux et les ovoproduits plus anciens. La Génétique comparative a permis aux chercheurs d'identifier plus de trois millions d'éléments dans l'ADN humain, dont environ la moitié était auparavant inconnue. Il s'est avéré qu'ils jouent un rôle essentiel dans la gestion de tous les processus physiologiques dans le corps et affectent où, quand et dans quelle quantité produire des protéines. Il s'est également avéré qu'environ 11% du génome (fragments d'ADN dits conservés) – environ 4 500 sites au total – étaient identiques chez tous les mammifères, y compris les humains. Ils sont nécessaires au fonctionnement normal du corps, et les changements génétiques en eux peuvent causer non seulement des maladies héréditaires, mais aussi le cancer.
Les généticiens qui étudient les sites associés au développement du cerveau («zones de développement accéléré humain» ou régions accélérées par l'homme) ont découvert qu'ils existent chez l'homme et chez les primates. Mais il y a environ un million d'années, des différences ont commencé à apparaître – l'emballage protéique de l'ADN a été reconstruit. Les» zones de développement humain accéléré " des anciens ancêtres de l'homme se sont accidentellement retrouvées à proximité d'activateurs – amplificateurs de l'activité des gènes, ce qui a marqué un tournant dans l'histoire de l'espèce Homo sapiens. Enhancer (anglais) enhancer-amplificateur, agrandisseur) – une petite partie de l'ADN qui, après la liaison avec les facteurs de transcription, stimule la transcription avec les principaux promoteurs d'un gène ou d'un groupe de gènes. Les activateurs ne se trouvent pas nécessairement à proximité des gènes dont ils régulent l'activité, ni même pas nécessairement sur le même chromosome.