Неизвестны: Указ о введении опричнины 7074 г. (1565 г.), духовное завещание 7090 г. (1553 г.) о передаче власти Дмитрию и Избранной Раде (правила 1553—65 г.). Зато сохранилось духовное завещание 1572 г. написанное при Анне Колтовской, в котором упоминается опричнина, но опричнина упразднена в 1571 г. и списки земельных угодий не соответствуют фактическому землевладению 1570—1600 г. известным по писцовым книгам. Текст его взят с неполной и неисправной копии 18 века.
Письма Курбского и Ивана Грозного известны только с 17 века. (С. Ф. Платонов. Иван Грозный.)
Хотя 07.01.1550 г. указан Собор во Владимире перед походом на Казань, но известен он лишь по хрущевскому списку Степенной Книги (написанном в 1691 г.) с единственным упоминанием о земском соборе 1550 г. вместе с генеалогиями дворян, подтасованными в 1686—87 г. (росписи родов 1681—89 годов – фальшивые). В первоначальном тексте Степенной Книги их не было. (С. Б. Веселовский. Исследования.)
Считается, что Иван Васильевич правил 51 год (1533—84 г.), но современник, Джером Горсей пишет: «царь Иван Васильевич правил более шестидесяти лет». (Смута в Московском государстве. 1989.)
«Время брака Бориса и Марии Скуратовой – неизвестно, то ли 1576 г., то ли 1578 г.».
«Время брака Федора Ивановича и Ирины Годуновой точно не установлено (вероятно, 1578, 1579 или 1580) (браки обычно были ранние)».
О Федоре Годунове (отце Бориса Федоровича) у историков нет сведений. (С. Б. Веселовский. Исследования.)
С. Б. Веселовский в 1963 г. указывал, что история России 16 века почти не исследована. (С. Б. Веселовский. Исследования.) Нет нормального, сверенного по именам и датам списка государственных назначений в России. Список думных чинов, изданный в 18 веке Новиковым не точен, но другого вообще нет. Те документы, которые все, же сохранились, в том числе хозяйственные т.к. они имели экономическое значение на местах, не изучены. Например, изучение документов по раздаче поместий из описи Поместного приказа (15—17 век) (сохранившихся, в отличие от местнических списков) в 20 веке почти не шло, а ранее, к 1900 г. они также практически не были исследованы. Светские архивы 16 века в России не сохранились. (Родина 2. 2004) А это архивы царей и уделов.
Известно, что в 1606 г. В. Шуйский приказал уничтожить все архивные документы, связанные с Дмитрием Ивановичем.