Краузе считал себя подлинным продолжателем Канта и категорически отвергал влияние Шеллинга, негодовал, когда его называли шеллингианцем. Он утверждал, что завершил университетское образование ещё до приезда Шеллинга в Йену и не поддался влиянию его трансцендентального идеализма, а, напротив, предполагал, что Шеллинг должен будет эволюционировать к спинозизму. Тем не менее, он признавал, что именно из системы Шеллинга легче всего подняться к «учению о сущности» (Wesenlehre), то есть к его собственной философии.
Он полагал, что Абсолют может быть познан, поэтому учение об Абсолюте и есть философия. Бог или Сущность познаётся:
1. Как пребывающий до и над всяким противоречием и всякой особой противоречивой сущностью (über jeder Gegenheit und Gegenwesenheit).
2. Также как сущий и существующий в себе и через себя, содержащий и объединяющий в себе противоречие и все частные противоречия как свободный и цельный «членосостав» (Gliedbau) сущностей.
3. В «усмотрении сущности» (Wesenschauung) познаётся, что Сущность в себе есть также всё противоречивое как Единое, и что она, пребывая до и над всем своим противоречивым и особенным, соединена со всем этим – как с каждым в отдельности, так и со всем в единстве.
Таким образом, в Wesenschauung Сущность познаётся как всеполноценное, совершенное Бытие. Это чистое и цельное усмотрение сущности и её высшая структура, по его мнению, отсутствуют в прежних философских системах, где Wesenschauung проявлялась лишь фрагментарно или через отрицание конечности.
Для развития этой науки существует двойной метод:
1. Восходящий (субъективный или аналитический) – от обыденного сознания к познанию Бога.
2. Нисходящий (объективный или синтетический) – от богопознания к развёртыванию всей системы наук.
Оба метода тождественны по содержанию, но различаются подходом.
Аналитическая часть начинается с несомненной непосредственной истины – самосознания, «самоусмотрения» (Selbstschauung) или основовоззрения «Я». При ближайшем рассмотрении «Я» оказывается единством тела и духа. Но выше этого мы осознаём себя как сущности, существующие до и над этим внутренним противоречием и его объединением. Так мы приходим к «Перво-Я» (Ur-Ich).
Тело принадлежит природе – бесконечному «самосущему» (Selbstwesen) в отношении времени, пространства, движения и силы, содержащему все уровни телесных существ. Дух – часть «царства духов» (Geisterreich), обычно называемого разумом, также бесконечное и единичное в своём роде.